我的变速箱在3年10万公里质保期内出现质量问题，厂家400客服电话答复说能够给予质保，但经初步检查后，此次变速箱故障可能与由第三方厂家更换的变速箱的底壳相关，厂家以此拒绝质保，但这个第三方的厂家提供的变速箱底壳，是我将汽车送到4S店修理，4S店为了多赚钱，在未和我商议的情况，擅作决定送到第三方厂家进行的维修。请问厂家以变速箱底壳在第三方维修，所以无法质保的做法是否合理么？若合理，无法质保的责任是否应由4S店全部承担？