空调面板同样采用全触控设计，平时位于中控屏下方快捷导航栏中，使用时点击风扇图标唤出即可。Model Y依旧配备了双区自动空调，并搭载了Model 3所不具备的生化过滤功能，通过高密度的HEPA过滤网+加大空调送风量实现净化车内空气的效果，理论上可以有效过滤0.1-0.3微米以上的微粒，阻隔病毒入侵。

　　舒适性配置方面，Model Y同样表现出彩，全景天幕尺寸比Model 3更大，并且没有中间的横梁干扰，后排乘客的采光面积非常可观，同时视野也更加开阔。全车5个座椅和方向盘均提供了加热功能，并且座椅统一为三档加热，不过只能通过中控屏进行调节。主/副驾驶座椅均支持8向电动调节，其中主驾驶座椅还多出了4向腰托调节和座椅记忆功能。后排座椅靠背支持手动调节，不过调节范围不大。